用最新的非 NA 值替换 NA

 

问题描述:

data.frame(或data.table)中,我想用最接近的先前非 NA 值“填充” NA。一个简单的例子,使用向量(而不是 a
data.frame)如下:

> y <- c(NA, 2, 2, NA, NA, 3, NA, 4, NA, NA)

我想要一个fill.NAs()允许我构造yy这样的函数:

> yy
[1] NA NA NA  2  2  2  2  3  3  3  4  4

我需要对许多(总共约 1 Tb)小型data.frames(约 30-50 Mb)重复此操作,其中一行是 NA 是它的所有条目。解决问题的好方法是什么?

我制作的丑陋解决方案使用此功能:

last <- function (x){
    x[length(x)]
}

fill.NAs <- function(isNA){
if (isNA[1] == 1) {
    isNA[1:max({which(isNA==0)[1]-1},1)] <- 0 # first is NAs 
                                              # can't be forward filled
}
isNA.neg <- isNA.pos <- isNA.diff <- diff(isNA)
isNA.pos[isNA.diff < 0] <- 0
isNA.neg[isNA.diff > 0] <- 0
which.isNA.neg <- which(as.logical(isNA.neg))
if (length(which.isNA.neg)==0) return(NULL) # generates warnings later, but works
which.isNA.pos <- which(as.logical(isNA.pos))
which.isNA <- which(as.logical(isNA))
if (length(which.isNA.neg)==length(which.isNA.pos)){
    replacement <- rep(which.isNA.pos[2:length(which.isNA.neg)], 
                                which.isNA.neg[2:max(length(which.isNA.neg)-1,2)] - 
                                which.isNA.pos[1:max(length(which.isNA.neg)-1,1)])      
    replacement <- c(replacement, rep(last(which.isNA.pos), last(which.isNA) - last(which.isNA.pos)))
} else {
    replacement <- rep(which.isNA.pos[1:length(which.isNA.neg)], which.isNA.neg - which.isNA.pos[1:length(which.isNA.neg)])     
    replacement <- c(replacement, rep(last(which.isNA.pos), last(which.isNA) - last(which.isNA.pos)))
}
replacement
}

该函数fill.NAs的使用如下:

y <- c(NA, 2, 2, NA, NA, 3, NA, 4, NA, NA)
isNA <- as.numeric(is.na(y))
replacement <- fill.NAs(isNA)
if (length(replacement)){
which.isNA <- which(as.logical(isNA))
to.replace <- which.isNA[which(isNA==0)[1]:length(which.isNA)]
y[to.replace] <- y[replacement]
}

输出

> y
[1] NA  2  2  2  2  3  3  3  4  4  4

…这似乎工作。但是,伙计,它丑吗!有什么建议么?


 

第 1 个答案:

您可能希望使用zoo包中的na.locf()函数来
进行最后一次观察 以替换您的 NA 值。 __

这是帮助页面中其用法示例的开头:

library(zoo)

az <- zoo(1:6)

bz <- zoo(c(2,NA,1,4,5,2))

na.locf(bz)
1 2 3 4 5 6 
2 2 1 4 5 2

na.locf(bz, fromLast = TRUE)
1 2 3 4 5 6 
2 1 1 4 5 2

cz <- zoo(c(NA,9,3,2,3,2))

na.locf(cz)
2 3 4 5 6 
9 3 2 3 2

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